Diventato professionista nel 1990, El Aynaoui si è distinto subito per il suo gioco d'attacco, caratterizzato da un potente servizio e da un ottimo dritto piatto. Destrimane, ha dato il meglio di sé sui campi veloci, che esaltavano appunto le sue qualità tecniche.
Nella sua carriera ha vinto 5 tornei di singolare e raggiunto altre 11 finali. Nel 1992 ha rappresentato il suo Paese alle Olimpiadi estive, dove è uscito al secondo turno. Il suo periodo migliore è stato dal 2000 al 2004: nel 2000 ha raggiunto i quarti agli Australian Open, nel 2002 i quarti agli US Open, nel 2003 ancora i quarti agli Australian Open (perdendo da Andy Roddick dopo un infinito match di oltre 5 ore, conclusosi 21-19 al quinto set) e agli US Open. In quegli anni ha raggiunto il suo best ranking, ovvero la piazza numero 14 (colta per l'esattezza nel 2003): nessun tennista suo connazionale si era mai classificato così in alto.
Ritiratosi a 39 anni, all'età di 45 anni ha fatto un breve ritorno nel circuito. Dopo oltre un anno e mezzo, il 23 agosto 2020 è tornato a giocare un match. Nelle qualificazioni del torneo ITF Men's World Tennis Tour M25 di Poznań, a quasi 49 anni, è stato sconfitto da Sergo Sikharulidze.
Marocco
Dutch Open, Amsterdam
Mariano Zabaleta
Romanian Open, Bucarest
Albert Montañés
Qatar ExxonMobil Open, Doha
BMW Open, Monaco di Baviera
Petr Korda
Jakarta Open, Giacarta
Movistar Open, Santiago del Cile
Cerveza Club Colombia Open, Bogotà
Grand Prix de Tennis de Lyon, Lione
Ivan Ljubičić
Dubai Tennis Championships, Dubai
Swedish Open, Båstad
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