La carriera di Risa Shinnabe inizia nei tornei studenteschi giapponesi. Nella stagione 2009-10 approda in V.Premier League (in seguito V.League Division 1), con le Hisamitsu Springs, club al quale si lega per tutta la sua carriera professionistica: nel corso delle undici annate trascorse nel club conquista cinque scudetti, sette edizioni della Coppa dell'Imperatrice, un Torneo Kurowashiki, un V.League Top Match e un campionato asiatico per club; le sue prestazioni sono inoltre impreziosite da numerosi riconoscimenti individuali, ricevendo un premio come miglior esordiente, cinque come miglior difesa, sei come miglior ricevitrice, tre apparizione nel sestetto ideale del campionato e una in quello del Torneo Kurowashiki, quattro premi d'onore e soprattutto quello di MVP del campionato 2013-14.
Il 20 giugno 2020 le Hisamitsu Springs annunciano il suo ritiro[1]; in seguito motivato dall'impossibilità di ritornare a un livello di gioco soddisfacente dopo un infortunio a un legamento dell'indice della mano destra, patito a inizio 2020[2][3].