La stagione 2009-2010 del Rodengo Saiano inizia il 12 agosto con la fase a gironi della coppa Italia Lega Pro dove affronterà Pavia, Lecco, Pro Sesto e Legnano, finendo il girone a punteggio pieno (12 punti) grazie alle 4 vittorie in altrettante partite. Il cammino in coppa Italia sarà poi interrotto dall'A.C. Lumezzane il 7 ottobre 2009 in occasione del primo turno della fase finale, gara nella quale la formazione di Leonardo Menichini si imporrà per 2-1, aggiudicandosi così il "derby di coppa".
Il campionato di Seconda Divisione inizia il 23 agosto nel derby bresciano contro il Carpenedolo. Purtroppo per gli uomini di Braghin le cose si mettono subito male e i franciacortini prendono due gol nel giro di 4 minuti, e a nulla è valsa la rete di Cassaro. Dopo uno scialbo pareggio con il Salò in casa, nel secondo dei tre derby della provincia di Brescia, il Rodengo comincia a vincere imponendosi prima a Noceto in casa dei Crociati per 2-1, e successivamente sempre 2-1 in casa contro il Mezzocorona.
I risultati utili consecutivi si allungano fino alla nona giornata formando una serie di 3 pareggi, di cui due esterni, e di 4 vittorie, di cui due esterne sui campi della Villacidrese e dello Spezia, consolidando così la posizione di alta classifica della formazione guidata da Braghin.
La seconda sconfitta stagionale arriva l'8 novembre sul campo del Südtirol e costa la perdita del primo posto, che verrà poi recuperato con una tre pareggi, contro Pro Vercelli, Pavia e Pro Belvedere e la vittoria in casa contro l'Olbia, prima di cedere il passo, e il titolo di "campioni d'Inverno" al Legnano dopo la sconfitta per 2-0 in trasferta contro questi ultimi.
Il girone d'andata per la formazione franciacortina si chiude quindi con un bilancio di 7 vittorie, 7 pareggi e 3 sconfitte, segnando 19 gol e subendone 13.
Il ritorno si apre con i due derby tutti bresciani contro il Carpenedolo e il Salò. Nel primo - giocato in casa - in franciacortini si impongono contro i rossoneri di Francesco Zanoncelli per 2-0, proiettando il Rodengo al provvisorio secondo posto in classifica, mentre con il nuovo anno invece arriva anche la prima sconfitta per 2-1, maturata nella seconda stra-provinciale sul campo dei verde-azzurri della Feralpi Salò, con la conseguente caduta al quinto posto in Lega Pro.
Lo sponsor tecnico per la stagione 2009-2010 è Remels, mentre gli sponsor sono Cristofoletti Lamiere - Incosider - Bontempi Vibo - Metra - Franciacorta Outlet Village - Bar Lollipop
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