マイナンバーでは入力間違いがあった場合にそれを検出できるよう、マイナンバーの最下位（一番右側の1桁） が「チェックデジット」に割り当てられている。チェックデジットの一般的な実装では、ナンバーの各桁を特定の数式で処理することで入力されたナンバーが間違っていないかどうかを検出できるのだが、マイナンバーのチェックデジットでは実装の仕様上、入力ミスの仕方によってはそれを検出できないのだという（デジタル・フォレンジック研究会の第404号コラム「マイナンバーのチェックデジットについて」）。

たとえばチェックデジットが0の場合、1桁の入力ミスのうち約9.1％を検出できないという。さらに法人番号については「0」と「9」を取り違えた場合、間違いを検出できないという。