Bázispár
A molekuláris biológiában bázispárnak nevezzük a komplementer DNS vagy RNS szálak egymással szemben elhelyezkedő, hidrogénkötésekkel összekapcsolt nukleotidpárját (gyakran bp-ként rövidítve). Mivel a DNS általában duplaszálú, a bázispárok száma megegyezik az egyik vagy másik szál nukleotidszámával. DNS-ben adenin (A) és timin (T), guanin (G) és citozin (C) lehet bázispár, míg RNS-ben timin helyett uracil (U) található.
Rövidítések
[szerkesztés]
A következő rövidítések használatosak a DNS/RNS molekulák hosszának leírásakor:
- kbp vagy kb = kilo bázispár = 1000 bp
- Mbp vagy Mb = mega bázispár = 1 000 000 bp
- Gbp vagy Gb = giga bázispár = 1 000 000 000 bp
Az egyszálú DNS/RNS esetén nukleotidokról beszélünk (rövidítve nt, így knt, Mnt, Gnt).
A nagyobb bázisok, az adenin és a guanin, kétgyűrűs vegyületek, ún. purinok. A kisebbek, a citozin, timin és az uracil, egygyűrűs vegyületek, ún. pirimidinek. Purinnal szemben a láncon csak pirimidin lehet, és fordítva. A pirimidin-pirimidin párosodás energetikailag veszteséges, mert a bázisok túl messze helyezkednek el egymástól a hidrogénkötés létrehozásához. A purin-purin párosodásnál pedig éppen a bázisok túl közel vannak egymáshoz, elektrosztatikai taszítás lép fel, így hasonlóan energetikailag a pirimidinekhez a kötés veszteséggel járna.
Az energetikailag kedvező párosodás tehát a guanin-citozin és az adenin-timin (illetve RNS-ben az adenin-uracil).
Mivel a hidrogénkötés nem nagyon erős, így 94 °C-nál magasabb hőmérsékleten a bázispárok szétszakadnak. A nukleinsav denaturálódik.
Nem megfelelő bázispárok létrejötte DNS replikációs és transzkripciós hibákhoz vezethet. Olyan analógok, melyek egyes nukleotidokat képesek helyettesíteni, így ugyancsak nem megfelelő bázispárosodást okoznak, karcinogének, mások kemoterápiás szerek.
Intramolekuláris bázispárok
[szerkesztés]Az RNS formálhat intramolekuláris bázispárokat. Így visszahajló szakasz keletkezik a fő RNS szálon kívül.