FlexboxLayoutManager の問題ではなく、TextView の measure() 実装の問題です（Issue Tracker に登録しました）。
どういう問題かというと、setCompoundDrawablesRelativeWithIntrinsicBounds() と setCompoundDrawablesWithIntrinsicBounds() で TextView の measure() の結果が異なり、setCompoundDrawablesRelativeWithIntrinsicBounds() だと measuredWidth/Height に CompoundDrawables のサイズが含まれないという問題です。 再現コードなどは上記の Issue に書いてあります。
FlexboxLayoutManager は MeasuredWidth/Height の値を使って View を配置しているため、TextView で setCompoundDrawablesRelativeWithIntrinsicBounds() や android:drawableStart, android:drawableEnd などで CompoundDrawable を指定すると、それを含まないサイズで配置され、文字が切れたり折り返して表示されてしまいます。
以下は RecyclerView + FlexboxLayoutManager の例です。
この例では、2行目は android:drawableLeft, android:drawableRight、4行目は android:drawableStart, android:drawableEnd を使っています。それ以外は同じです。セットされているテキストも両方 "Hello Android" です。
2行目用のレイアウト
<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<TextView xmlns:android="http://schemas.android.com/apk/res/android"
android:id="@+id/textView"
android:layout_width="wrap_content"
android:layout_height="wrap_content"
android:drawableLeft="@drawable/square"
android:drawableRight="@drawable/square" />
4行目用のレイアウト
<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<TextView xmlns:android="http://schemas.android.com/apk/res/android"
android:id="@+id/textView"
android:layout_width="wrap_content"
android:layout_height="wrap_content"
android:drawableEnd="@drawable/square"
android:drawableStart="@drawable/square" />
android:drawableStart, android:drawableEnd を使った4行目では、CompoundDrawable のサイズが measuredWidth/Height に反映されず、その分文字の領域が小さくなって "Hello Android" の Android が切れたり、square の下のほうが切れたりしています。
このように CompoundDrawable を relative 系の属性、メソッドで指定すると問題があるため、setCompoundDrawablesWithIntrinsicBounds() や android:drawableLeft, android:drawableRight を使いましょう。
