少し真面目に家系図と家系データ - ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ

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少し真面目に家系図と家系データ - ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ

分離比解析をやっているたくさんの家系データを作りたい昨日の記事でグラフの成長ルールで家系を作る... 分離比解析をやっているたくさんの家系データを作りたい昨日の記事でグラフの成長ルールで家系を作る話を『なんちゃって家系図』として書いた遺伝リスクやリスクアレルの伝達も含めて、少しきちんと作ってみる設定家系データの作り方家系図を以下の要領で作成する trio行列は１行に１人第１列は個人ID 第２列は父親ID(0は情報なし) 第３列は母親ID 第４列は性別(1:male,-1:female) 第５列は世代番号手順1 第0世代にn.init人を作成する手順2 初期n.init人の性別はランダムに与える手順3 次いで、指定人数 n.iter人を次の要領で付け加える手順4 すでに登録された個人から一人xを選ぶ手順5-1 xが誰の親でもないときには、新たな配偶者を同世代に1人作成し、そのペアの間に、平均子供数mean.kidでポアソン分布に従う子供を作る手順5-2すでに子供が居

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