PSMC4

PSMC4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2DVW
Ідентифікатори
Символи	PSMC4, MIP224, RPT3, S6, TBP-7, TBP7, proteasome 26S subunit, ATPase 4
Зовнішні ІД	OMIM: 602707 MGI: 1346093 HomoloGene: 4744 GeneCards: PSMC4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • ATPase activity; • hydrolase activity; • TBP-class protein binding; • ATP binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • proteasome-activating activity;
Клітинна компонента	• proteasome regulatory particle, base subcomplex; • inclusion body; • cytosolic proteasome complex; • мембрана; • nuclear proteasome complex; • proteasome accessory complex; • Протеасома; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • цитоплазма; • гіалоплазма; • синапс;
Біологічний процес	• NIK/NF-kappaB signaling; • протеоліз; • MAPK cascade; • regulation of mRNA stability; • protein polyubiquitination; • Fc-epsilon receptor signaling pathway; • regulation of cellular amino acid metabolic process; • GO:0044257 protein catabolic process; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • blastocyst development; • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; • ubiquitin-dependent ERAD pathway; • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process; • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; • positive regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly; • T cell receptor signaling pathway; • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway; • positive regulation of proteasomal protein catabolic process; • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle; • protein deubiquitination; • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • трансмембранний транспорт; • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia; • посттрансляційна модифікація; • regulation of hematopoietic stem cell differentiation; • interleukin-1-mediated signaling pathway; • regulation of mitotic cell cycle phase transition;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5704
	23996
	ENSG00000281221; ENSG00000013275
	ENSMUSG00000030603
	P43686
	P54775
	NM_153001; NM_006503
	NM_011874
	NP_006494; NP_694546
	NP_036004
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PSMC4 (англ. Proteasome 26S subunit, ATPase 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 418 амінокислот, а молекулярна маса — 47 366^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEEIGILVEK	AQDEIPALSV	SRPQTGLSFL	GPEPEDLEDL	YSRYKKLQQE
LEFLEVQEEY	IKDEQKNLKK	EFLHAQEEVK	RIQSIPLVIG	QFLEAVDQNT
AIVGSTTGSN	YYVRILSTID	RELLKPNASV	ALHKHSNALV	DVLPPEADSS
IMMLTSDQKP	DVMYADIGGM	DIQKQEVREA	VELPLTHFEL	YKQIGIDPPR
GVLMYGPPGC	GKTMLAKAVA	HHTTAAFIRV	VGSEFVQKYL	GEGPRMVRDV
FRLAKENAPA	IIFIDEIDAI	ATKRFDAQTG	ADREVQRILL	ELLNQMDGFD
QNVNVKVIMA	TNRADTLDPA	LLRPGRLDRK	IEFPLPDRRQ	KRLIFSTITS
KMNLSEEVDL	EDYVARPDKI	SGADINSICQ	ESGMLAVREN	RYIVLAKDFE
KAYKTVIKKD	EQEHEFYK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Choi H.S., Seol W., Moore D.D. (1996). A component of the 26S proteasome binds on orphan member of the nuclear hormone receptor superfamily. J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 56: 23—30. PMID 8603043 DOI:10.1016/0960-0760(95)00220-0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Dubiel W., Ferrell K., Rechsteiner M. (1994). Tat-binding protein 7 is a subunit of the 26S protease. Biol. Chem. Hoppe-Seyler. 375: 237—240. PMID 8060531 DOI:10.1515/bchm3.1994.375.4.237
Huang X., Luan B., Wu J., Shi Y. (2016). An atomic structure of the human 26S proteasome. Nat. Struct. Mol. Biol. 23: 778—785. PMID 27428775 DOI:10.1038/nsmb.3273

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9551 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P43686 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.