CAMK2D

CAMK2D
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2VN9, 2W2C, 2WEL, 3GP2
Ідентифікатори
Символи	CAMK2D, CAMKD, calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta
Зовнішні ІД	OMIM: 607708 MGI: 1341265 HomoloGene: 55561 GeneCards: CAMK2D
Пов'язані генетичні захворювання
	хронічний лімфолейкоз
Онтологія гена
Молекулярна функція	• kinase activity; • ATP binding; • protein kinase activity; • titin binding; • transferase activity; • protein homodimerization activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleotide binding; • sodium channel inhibitor activity; • calmodulin-dependent protein kinase activity; • protein serine/threonine kinase activity; • transmembrane transporter binding; • calmodulin binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• endocytic vesicle membrane; • мембрана; • sarcoplasmic reticulum membrane; • клітинна мембрана; • нуклеоплазма; • sarcoplasmic reticulum; • Сарколема; • neuron projection; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма; • Кальцієві канали;
Біологічний процес	• regulation of heart contraction; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of membrane depolarization; • positive regulation of cardiac muscle hypertrophy; • protein phosphorylation; • cellular response to calcium ion; • regulation of cardiac muscle cell action potential involved in regulation of contraction; • regulation of histone deacetylase activity; • regulation of cellular localization; • negative regulation of sodium ion transmembrane transport; • фосфорилювання; • regulation of the force of heart contraction; • regulation of cardiac muscle contraction by regulation of the release of sequestered calcium ion; • regulation of ryanodine-sensitive calcium-release channel activity; • negative regulation of sodium ion transmembrane transporter activity; • MAPK cascade; • protein complex oligomerization; • regulation of cell growth; • regulation of cellular response to heat; • regulation of cell communication by electrical coupling involved in cardiac conduction; • regulation of heart rate by cardiac conduction; • нейробіологія розвитку; • диференціація клітин; • regulation of cell communication by electrical coupling; • positive regulation of cardiac muscle cell apoptotic process; • regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum; • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation; • peptidyl-threonine phosphorylation; • endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis; • protein autophosphorylation; • relaxation of cardiac muscle; • cardiac muscle cell contraction; • regulation of cardiac muscle cell action potential; • regulation of relaxation of cardiac muscle; • regulation of calcium ion transmembrane transport via high voltage-gated calcium channel;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	817
	108058
	ENSG00000145349
	ENSMUSG00000053819
	Q13557
	Q6PHZ2
NM_001221; NM_172114; NM_172115; NM_172127; NM_172128;
	NM_172129; NM_001321566; NM_001321567; NM_001321568; NM_001321569; NM_001321570; NM_001321571; NM_001321572; NM_001321573; NM_001321574; NM_001321575; NM_001321576; NM_001321577; NM_001321578; NM_001321579; NM_001321580; NM_001321581; NM_001321582; NM_001321583; NM_001321584; NM_001321585; NM_001321586; NM_001321587; NM_001321588; NM_001321589; NM_001321590; NM_001321591; NM_001321592; NM_001396964; NM_001396965; NM_001396966; NM_001396967; NM_001399855; NM_001399856; NM_001399857; NM_001399858; NM_001399859; NM_001399860; NM_001399861; NM_001399862; NM_001399863; NM_001399864; NM_001399865
NM_001025438; NM_001025439; NM_001293663; NM_001293664; NM_001293665;
	NM_001293666; NM_023813; NM_001346635; NM_001346636
NP_001212; NP_001308495; NP_001308496; NP_001308497; NP_001308498;
	NP_001308499; NP_001308500; NP_001308501; NP_001308502; NP_001308503; NP_001308504; NP_001308505; NP_001308506; NP_001308507; NP_001308508; NP_001308509; NP_001308510; NP_001308511; NP_001308512; NP_001308513; NP_001308514; NP_001308515; NP_001308516; NP_001308517; NP_001308518; NP_001308519; NP_001308520; NP_001308521; NP_742112; NP_742113; NP_742125; NP_742126; NP_742127
NP_001020609; NP_001020610; NP_001280592; NP_001280593; NP_001280594;
	NP_001280595; NP_001333564; NP_001333565; NP_076302
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CAMK2D (англ. Calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 499 амінокислот, а молекулярна маса — 56 369^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASTTTCTRF	TDEYQLFEEL	GKGAFSVVRR	CMKIPTGQEY	AAKIINTKKL
SARDHQKLER	EARICRLLKH	PNIVRLHDSI	SEEGFHYLVF	DLVTGGELFE
DIVAREYYSE	ADASHCIQQI	LESVNHCHLN	GIVHRDLKPE	NLLLASKSKG
AAVKLADFGL	AIEVQGDQQA	WFGFAGTPGY	LSPEVLRKDP	YGKPVDMWAC
GVILYILLVG	YPPFWDEDQH	RLYQQIKAGA	YDFPSPEWDT	VTPEAKDLIN
KMLTINPAKR	ITASEALKHP	WICQRSTVAS	MMHRQETVDC	LKKFNARRKL
KGAILTTMLA	TRNFSAAKSL	LKKPDGVKES	TESSNTTIED	EDVKARKQEI
IKVTEQLIEA	INNGDFEAYT	KICDPGLTAF	EPEALGNLVE	GMDFHRFYFE
NALSKSNKPI	HTIILNPHVH	LVGDDAACIA	YIRLTQYMDG	SGMPKTMQSE
ETRVWHRRDG	KWQNVHFHRS	GSPTVPIKPP	CIPNGKENFS	GGTSLWQNI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою кальмодуліну. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, саркоплазматичному ретикулумі.

Література

Hoch B., Meyer R., Hetzer R., Krause E.-G., Karczewski P. (1999). Identification and expression of delta-isoforms of the multifunctional Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase in failing and nonfailing human myocardium. Circ. Res. 84: 713—721. PMID 10189359 DOI:10.1161/01.RES.84.6.713
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tombes R.M., Krystal G.W. (1997). Identification of novel human tumor cell-specific CaMK-II variants. Biochim. Biophys. Acta. 1355: 281—292. PMID 9060999 DOI:10.1016/S0167-4889(96)00141-3
Rose A.J., Kiens B., Richter E.A. (2006). Ca2+-calmodulin-dependent protein kinase expression and signalling in skeletal muscle during exercise. J. Physiol. (Lond.). 574: 889—903. PMID 16690701 DOI:10.1113/jphysiol.2006.111757
Little G.H., Bai Y., Williams T., Poizat C. (2007). Nuclear calcium/calmodulin-dependent protein kinase IIdelta preferentially transmits signals to histone deacetylase 4 in cardiac cells. J. Biol. Chem. 282: 7219—7231. PMID 17179159 DOI:10.1074/jbc.M604281200
Maier L.S., Bers D.M. (2007). Role of Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase (CaMK) in excitation-contraction coupling in the heart. Cardiovasc. Res. 73: 631—640. PMID 17157285 DOI:10.1016/j.cardiores.2006.11.005