เอพิโทป
หน้าตา
เอพิโทป (อังกฤษ: epitope หรือ antigenic determinant) เป็นตำแหน่งบนโมเลกุลแอนติเจนที่องค์ประกอบของภูมิคุ้มกันรวมทั้งแอนติบอดี เซลล์บี และ/หรือเซลล์ทีรู้จัก เป็นตำแหน่งจำเพาะของแอนติเจนที่แอนติบอดีเข้าจับ โดยส่วนของแอนติบอดีที่เข้ายึดกับเอพิโทปเรียกว่า พาราโทป (paratope) แม้ปกติเอพิโทปจะเป็นโปรตีนนอกร่างกาย (non-self protein) แต่บางครั้งโปรตีนในร่างกายที่ภูมิคุ้มกันเข้าจับ (เช่นในกรณีโรคภูมิต้านตนเอง) ก็ถือเป็นเอพิโทปได้เช่นกัน[1]
เชิงอรรถและอ้างอิง
[แก้]- ↑ Mahmoudi Gomari, Mohammad; Saraygord-Afshari, Neda; Farsimadan, Marziye; Rostami, Neda; Aghamiri, Shahin; Farajollahi, Mohammad M. (2020-12-01). "Opportunities and challenges of the tag-assisted protein purification techniques: Applications in the pharmaceutical industry". Biotechnology Advances (ภาษาอังกฤษ). 45: 107653. doi:10.1016/j.biotechadv.2020.107653. ISSN 0734-9750. PMID 33157154.
แหล่งข้อมูลอื่น
[แก้]- Antibodies bind to conformational shapes on the surfaces of antigens (Janeway Immunobiology Section 3.8)
- Antigens can bind in pockets or grooves, or on extended surfaces in the binding sites of antibodies (Janeway Immunobiology Figure 3.8)
วิธีการพยากรณ์
[แก้]- Rubinstein, ND; Mayrose, I; Martz, E; Pupko, T (September 2009). "Epitopia: a web-server for predicting B-cell epitopes". BMC Bioinformatics. 10: 287. doi:10.1186/1471-2105-10-287. PMC 2751785. PMID 19751513.
- Rubinstein, ND; Mayrose, I; Pupko, T (February 2009). "A machine-learning approach for predicting B-cell epitopes". Molecular Immunology. 46 (5): 840–7. doi:10.1016/j.molimm.2008.09.009. PMID 18947876.
- Saravanan, V; Gautham, N (October 2015). "Harnessing Computational Biology for Exact Linear B-Cell Epitope Prediction: A Novel Amino Acid Composition-Based Feature Descriptor". Omics. 19 (10): 648–58. doi:10.1089/omi.2015.0095. PMID 26406767.
- Singh, H; Ansari, HR; Raghava, GP (2013). "Improved method for linear B-cell epitope prediction using antigen's primary sequence". PLOS ONE. 8 (5): e62216. Bibcode:2013PLoSO...862216S. doi:10.1371/journal.pone.0062216. PMC 3646881. PMID 23667458.
ฐานข้อมูล
[แก้]- MHCBN: A database of MHC/TAP binder and T-cell epitopes
- Bcipep: A database of B-cell epitopes
- SYFPEITHI - First online database of T cell epitopes
- IEDB - Database of T and B cell epitopes with annotation of recognition context - NIH funded
- ANTIJEN - T and B cell epitope database at the Jenner institute, UK
- IMGT/3Dstructure-DB - Three-dimensional structures of B and T cell epitopes with annotation of IG and TR - IMGT, Montpellier, France
- SEDB: A Structural Epitope Database - Pondicheery University, DIT funded
- Epitopes ในหอสมุดแพทยศาสตร์แห่งชาติอเมริกัน สำหรับหัวข้อเนื้อหาทางการแพทย์ (MeSH)