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- 自 2013 年 11 月 1 日起，人感染 H7N9 禽流感纳入法定乙类传染病进行管理，甲型 H1N1 流感从乙类调整至丙类，并归并至流行性感冒进行统计。2013 年甲乙类传染病合计中包括 2013 年 1–10 月甲型 H1N1 流感报告发病数和死亡数。
- 自 2019 年 5 月 1 日起，结核性胸膜炎归入肺结核分类统计，不再报告到「其他法定管理以及重点监测传染病」中。
- 自 2020 年 1 月 20 日起，新型冠状病毒肺炎纳入乙类传染病管理。
- 自 2023 年 9 月 20 日起，猴痘纳入乙类传染病管理。