La saison 1988-1989 du Championnat du Mali de football était la 22e édition de la première division malienne à poule unique, la Première Division. Les douze meilleurs clubs maliens sont répartis en deux poules où ils s'affrontent en matchs aller-retour. Les deux meilleurs de chaque groupe se qualifient pour la poule pour le titre tandis que le dernier est relégué en deuxième division.
C'est le club du Stade malien qui remporte la compétition après avoir terminé en tête de la poule finale, avec six points d'avance sur le tenant du titre, Djoliba AC et sept sur l'AS Real Bamako et l'AS Firhoun. C'est le cinquième titre de champion du Mali de l'histoire du club.
Les saisons en gris n'ont pas été disputées. Les saisons en noir (et toutes celles avant 1988) sont celles dont on ne connaît que le champion (voir le palmarès).