Pravilnikom o radu Agencije za zaštitu osobnih podataka uređeno je unutarnje ustrojstvo, a čine ga:

KABINET RAVNATELJA

Tajnica Kabineta ravnatelja: Milkica Gudeljević

E-mail: [email protected]

Kontakt: 01 4609 019

SAMOSTALNA SLUŽBA ZA LJUDSKE RESURSE, OPĆE, FINANCIJSKO-PLANSKE I RAČUNOVODSTVENE POSLOVE

Voditeljica: Sanja Silaj Zeman

E-mail: [email protected]

SEKTOR ZA NADZOR, ISTRAGE I ZAŠTITU PRAVA ISPITANIKA

Načelnik: Mario Milner

E-mail: [email protected]

Služba za zaštitu i promicanje prava ispitanika

Voditeljica: Petra Papić

E-mail: [email protected]

Služba za nadzor, istrage, tehnologije i sigurnost

Voditelj: Siniša Kovačić

E-mail: [email protected]

SEKTOR ZA EU, MEĐUNARODNU SURADNJU I PRAVNE POSLOVE

Načelnica: Anamarija Mladinić

E-mail: [email protected]

Služba za pravno savjetovanje, suradnju i projekte

Voditelj: Marko Trošelj

E-mail: [email protected]

Služba za međunarodne prijenose podataka i mehanizme sukladnosti  

Voditelj: Iva Perin Tomičić

E-mail: [email protected]

Agencijom su rukovodili:

Franjo Lacko, dipl.iur, u razdoblju od 2004. do 2012. godine (ravnatelj)
Vilena Gašparović, dipl.iur., u razdoblju od 2004. do 2012. godine (zamjenica ravnatelja)
Dubravko Bilić, mag.philol.croat., u razdoblju od 2012. do 2013. godine (ravnatelj)
Dubravka Dolenc, dipl. iur., u razdoblju od 2012. do 2016. godine (zamjenica ravnatelja)
Anto Rajkovača, u razdoblju od 2014. do 2020. godine (ravnatelj)