Idei powstania Instytutu towarzyszyło głębokie przeświadczenie o konieczności pielęgnowania ale i rozwoju dziedzictwa intelektualnego Pawła Adamowicza, Jego dorobku oraz tego w co wierzył jako człowiek, obywatel i Prezydent Miasta Gdańska.
Głównymi celami Instytutu Pawła Adamowicz są:
Umacnianie wartości demokratycznych
Praw i wolności człowieka i obywatela
Umacnianie praworządności oraz zasad państwa prawa
Wspieranie wolności mediów i prawa do rzetelnej informacji
Przeciwdziałanie mowie nienawiści
Aktywizacja społeczna i obywatelska, urzeczywistnianie idei społeczeństwa obywatelskiego
Rozwijanie idei samorządności, wspieranie w rozwoju jednostek samorządu terytorialnego
Upowszechnianie wiedzy o przebiegu i znaczeniu przemian demokratycznych w Polsce i w Europie, w szczególności o roli Solidarności
Upowszechnianie wiedzy o współczesnej historii Polski w celu kształtowania nowoczesnego modelu patriotyzmu oraz umacniania tożsamości narodowej
Wzmacnianie idei i inicjowanie działań na rzecz integracji europejskiej
Wsparcie działań na rzecz integracji cudzoziemców oraz tolerancji wobec mniejszości
